脑炎病毒包括日本脑炎病毒（Japanese encephalitis virus, JEV）、圣路易斯脑炎病毒（St. Louis encephalitis virus, SLEV）和蜱传脑炎病毒（Tick-borne encephalitis virus, TBEV）等，均为有囊膜的单股正链RNA病毒，属于黄病毒科黄病毒属。这类病毒主要通过蚊虫或蜱等节肢动物媒介传播，可在鸟类、哺乳动物等脊椎动物宿主间形成自然循环。脑炎病毒在特定地理区域呈地方性流行，其传播活动具有明显的季节性和生态依赖性。由于这类病毒可侵犯中枢神经系统并引发严重疾病，对其传播生态学、遗传演化及跨种传播潜力的持续研究具有重要意义。

脑炎病毒（以JEV、SLEV、TBEV为代表）属于黄病毒科，其病毒粒子呈球形，直径约40-50 nm，具有二十面体对称的核衣壳和脂质包膜。病毒基因组为不分节段的单股正链RNA，长约11kb，编码三种结构蛋白（C、prM/M、E）和七种非结构蛋白（NS1、NS2A、NS2B、NS3、NS4A、NS4B、NS5）。整个病毒粒子从内到外主要由核衣壳和病毒包膜构成。核衣壳由基因组RNA与衣壳蛋白（C蛋白）结合形成，构成病毒的遗传物质核心。病毒包膜来源于宿主细胞内质网膜，表面镶嵌有膜蛋白（M蛋白）和包膜蛋白（E蛋白），其中E蛋白以二聚体形式形成病毒表面刺突。E蛋白负责识别宿主细胞表面受体、介导膜融合与病毒入侵，是决定病毒细胞嗜性、宿主范围的关键分子，同时也是诱导宿主产生中和抗体的主要抗原靶点。E蛋白的Ⅲ结构域含有重要的抗原表位，其遗传变异与病毒的血清型、毒力及免疫逃逸特性密切相关，这为相关诊断试剂、疫苗研发及流行病学研究提供了关键的分子基础。

在科研中，比较常用的JEV/SLEV/TBEV研究工具包括：